Apotek saat ini menjadi salah satu bisnis dengan potensi yang menjanjikan sehingga tidak mengherankan jika banyak pihak yang ingin berbisnis dalam bidang ini. Apotek yang kini juga menjadi salah satu bentuk bisnis waralaba semakin memudahkan masyarakat untuk mendirikan suatu apotek. Keberhasilan setiap usaha tidak lepas dari ketepatan dalam pemilihan lokasi. Pencarian lokasi apotek yang strategis sangat menentukan keberhasilan apotek karena berhubungan erat dengan aspek pasar. Pencarian lokasi apotek pada umumnya dilakukan dengan melakukan survey lokasi secara langsung. Survey lapangan tentu saja membutuhkan tenaga dan waktu yang tidak sedikit. Untuk menghemat tenaga dan waktu, pada makalah ini kami mengajukan pendekatan baru dengan menggunakan sistem pendukung keputusan yang dapat membantu untuk memberikan rekomendasi lokasi pendirian apotek baru dengan menggunakan Fuzzy Query dan GIS. Kriteria yang digunakan oleh aplikasi ini sebagai bahan pertimbangan pemberian rekomendasi adalah jarak dengan jalan raya, jumlah fasilitas kesehatan, jumlah apotek pesaing, kemudahan akses transportasi, jarak dengan pemukiman, dan tren pertumbuhan penduduk. Kriteria tersebut diolah dengan menggunakan metode Fuzzy Query. Sistem ini mampu menghasilkan rekomendasi atas kriteria yang diinginkan pengguna. Hasil rekomendasi yang diberikan kemudian divisualisasikan dalam peta dengan menggunakan Google Maps.